Entre as vantagens da mudança destacam-se a possibilidade de ampliação da rede credenciada, por meio de convênios com outras caixas de assistência e com planos de saúde de todo o Brasil e a possível criação de novas coberturas.

A diretoria da Caixa de Assistência é composta por indicação: 02 membros, empregados da Embrapa, indicados pela própria Embrapa e 01 membro, empregado da Embrapa indicado pelo Sindicato Nacional dos Trabalhadores de Pesquisa e Desenvolvimento Agropecuário (SINPAF), sendo que os 03 membros precisam ser aprovados pelo presidente da Embrapa em exercício, quando da aprovação, são empossados para mandato de 03 anos, podendo ser reconduzido por igual período.

A Embrapa assume a responsabilidade do pagamento de parte da contraprestação pecuniária para empregados ativos.